在线绘制-在线流程图怎么绘制？

相信大家都听说过circos图,但是亲自画过的人可能就很少,这主要因为软件的安装和使用稍微有一点麻烦。其实,circos图也是可以在线绘制的,这样就简单多了!一起来了解一下吧!

在circos官网(

/

)的最右方有个“CIRCOS ONLINE”选项,这里可以实现在线绘制部分circos图。

打开后界面如下:

以微生物多样性分析中样品与物种丰度circos图绘制为例,给大家讲解circos图的绘制功能。该图能够很直观的反映各样品中不同物种所占的比例,以及物种在不同分组或者样品中的分布关系。

绘制circos图

1.数据准备

首先我们要做的就是准备画图所用到的数据,所用数据为物种在各样品中的相对丰度,这里只选用丰度大于0.01的物种用于绘图,数据如下(列名A、B、C为样品,行名Acetobacteraceae等是科一水平的物种分类):

OTUABC

Acetobacteraceae0.5063653216696110.5968872412369940.457528142134733

Arcobacteraceae0.0003294904846044670.0179133872520980.000426249200782749

Bacteroidaceae0.01752092807693420.04558718113953470.352221339584988

Dysgonomonadaceae0.001842974249051360.02565003004872960.0330226880824598

Lachnospiraceae0.005691857602178260.01390206286339050.0173870923992018

Lactobacillaceae0.174952205775860.2379461150250890.0588340146862225

Pseudomonadaceae0.00213263621353880.02862956070929480.0127991010016856

Ruminococcaceae0.003124728441908290.005061219761203110.0274388235522058

Sphingomonadaceae0.2578607015612780.007113946230875610.00898610815104722

由于网站要求的数据格式为非负整数,故将所有的数据乘1000(系统会自动截掉小数点后的数据),输入数据则变为:

OTUABC

Acetobacteraceae506.365321669611596.887241236994457.528142134733

Arcobacteraceae0.32949048460446717.9133872520980.426249200782749

Bacteroidaceae17.520928076934245.5871811395347352.221339584988

Dysgonomonadaceae1.8429742490513625.650030048729633.0226880824598

Lachnospiraceae5.6918576021782613.902062863390517.3870923992018

Lactobacillaceae174.95220577586237.94611502508958.8340146862225

Pseudomonadaceae2.132636213538828.629560709294812.7991010016856

Ruminococcaceae3.124728441908295.0612197612031127.4388235522058

Sphingomonadaceae257.8607015612787.113946230875618.98610815104722

2.绘图

数据准备好就可以来绘制circos图了,只需要导入数据就可以。

生成的图片如下:

可以看到,图中的物种和样品完全是按照字母顺序排列的,我们希望物种和样品分别位列两边,这里可以人为的对其指定顺序。方法也很简单,就是在数据的第一行和第一列用数字来指定顺序。如下:

OTUOTU1   2   3

OTUOTUABC

12Acetobacteraceae506.365321669611596.887241236994457.528142134733

10Bacteroidaceae17.520928076934245.5871811395347352.221339584988

8Dysgonomonadaceae1.8429742490513625.650030048729633.0226880824598

6Lachnospiraceae5.6918576021782613.902062863390517.3870923992018

11Lactobacillaceae174.95220577586237.94611502508958.8340146862225

7Pseudomonadaceae2.132636213538828.629560709294812.7991010016856

5Ruminococcaceae3.124728441908295.0612197612031127.4388235522058

9Sphingomonadaceae257.8607015612787.113946230875618.98610815104722

4Arcobacteraceae0.32949048460446717.9133872520980.426249200782749

第一行指定了样品的顺序,而第一列按丰度指定物种的顺序。生成图片时要勾选下图红框中的选项(排序所用),不然会报错哦!

新图如下:

图中由于部分物种丰度较低,导致物种名重叠,解决这个问题可以改变文字的布局。这时就需要进行设置了。

3.图片设置

点击"settings"进入设置界面,会有很多的设置选项,可以对图片进行细调。

这里只需要修改两个地方即可,将下图第一个红框改为“no”,可以调整文字为垂直布局,避免重叠;但是如果物种名太长,又可能会超出图片范围,所以要缩小圆圈的半径,即将第二个红框改为small。

修改并保存设置后,重新生成图片:

好了,今天我就先给大家介绍到这里,希望对您的科研能有所帮助!祝您工作生活顺心快乐!

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在思维导图的领域里面也有很多我们所未知的领域,值得我们去探索并使用,思维导图的样式也有很多的选择,每种样式所适用的场合不同带来的帮助也不同,下面是展示的在怎样在绘制思维导图网站中绘制鱼骨图的操作方法介绍,希望可以帮助到大家。

绘制工具:

迅捷画图,电脑

绘制方法:

1.进入在线网站中,选择页面中栏目上方思维导图进行编辑使用。

2.进入思维导图页面,选择页面中的立即体验进行编辑使用。

3.进入该在线编辑页面中之后,不要急着进行编辑使用,这里讲述的就是鱼骨图,在页面上方的外观栏目中选择鱼骨图样式进行点击使用。

4.之后在对节点进行添加使用。围绕面板中的中心主题对其进行编辑使用,右键点击中心主题之后选择下级进行编辑使用。

5.节点添加完成之后双击节点可以进行编辑使用,在外观栏目中还可以对添加的字体大小以及字体样式进行编辑使用。

6.在外观栏目中还可以对其框架颜色,背景颜色等进行设置使用,可以进行编辑。

7.绘制完鱼骨图之后就可以对其导出进行编辑使用,在面板的右上方中选择导出操作之后选择导出格式就可以进行导出使用。

以上就是在在线网站中绘鱼骨图的操作方法介绍,鱼骨图的使用也是比较常见的,绘制方法给大家讲解的很清楚,希望可以帮助到大家。

在线流程图可以不用下载软件就能够绘制流程图,进入迅捷流程图官网,点击“在线版”就可以在空白模板中绘制导图。如果是新手,可以点击“模板下载”进入选择一个流程图模板,然后点击“在线编辑”既可以在线绘制了。

这里为了方便操作,用的是空白模板制作一张简单的流程图;

步骤一:在左边的图库中选择”流程图“,在选择需要的图形符号;

步骤二:选择线型将图形链接起来让其有相关性;

步骤三:在右边的图表样式中,可以更改文本,图形样式;

步骤四:全选图形,可以移动流程图位置;

步骤五:制作完成后,按”ctrl+S“保存即可;