96编辑器旗下产品
找图
终身
ID:0
到期时间:永久
退出登录
您的位置:首页 > 百科管理 > 详情

数据图制作在线-数据流程图怎么画?

原创:找图网 2023-04-11 15:19:55
  • 教你在线绘制circos图-简单!

  • 相信大家都听说过circos图,但是亲自画过的人可能就很少,这主要因为软件的安装和使用稍微有一点麻烦。其实,circos图也是可以在线绘制的,这样就简单多了!一起来了解一下吧!

    在circos官网(

    /

    )的最右方有个“CIRCOS ONLINE”选项,这里可以实现在线绘制部分circos图。

    打开后界面如下:

    以微生物多样性分析中样品与物种丰度circos图绘制为例,给大家讲解circos图的绘制功能。该图能够很直观的反映各样品中不同物种所占的比例,以及物种在不同分组或者样品中的分布关系。

    绘制circos图

    1.数据准备

    首先我们要做的就是准备画图所用到的数据,所用数据为物种在各样品中的相对丰度,这里只选用丰度大于0.01的物种用于绘图,数据如下(列名A、B、C为样品,行名Acetobacteraceae等是科一水平的物种分类):

    OTUABC

    Acetobacteraceae0.5063653216696110.5968872412369940.457528142134733

    Arcobacteraceae0.0003294904846044670.0179133872520980.000426249200782749

    Bacteroidaceae0.01752092807693420.04558718113953470.352221339584988

    Dysgonomonadaceae0.001842974249051360.02565003004872960.0330226880824598

    Lachnospiraceae0.005691857602178260.01390206286339050.0173870923992018

    Lactobacillaceae0.174952205775860.2379461150250890.0588340146862225

    Pseudomonadaceae0.00213263621353880.02862956070929480.0127991010016856

    Ruminococcaceae0.003124728441908290.005061219761203110.0274388235522058

    Sphingomonadaceae0.2578607015612780.007113946230875610.00898610815104722

    由于网站要求的数据格式为非负整数,故将所有的数据乘1000(系统会自动截掉小数点后的数据),输入数据则变为:

    OTUABC

    Acetobacteraceae506.365321669611596.887241236994457.528142134733

    Arcobacteraceae0.32949048460446717.9133872520980.426249200782749

    Bacteroidaceae17.520928076934245.5871811395347352.221339584988

    Dysgonomonadaceae1.8429742490513625.650030048729633.0226880824598

    Lachnospiraceae5.6918576021782613.902062863390517.3870923992018

    Lactobacillaceae174.95220577586237.94611502508958.8340146862225

    Pseudomonadaceae2.132636213538828.629560709294812.7991010016856

    Ruminococcaceae3.124728441908295.0612197612031127.4388235522058

    Sphingomonadaceae257.8607015612787.113946230875618.98610815104722

    2.绘图

    数据准备好就可以来绘制circos图了,只需要导入数据就可以。

    生成的图片如下:

    可以看到,图中的物种和样品完全是按照字母顺序排列的,我们希望物种和样品分别位列两边,这里可以人为的对其指定顺序。方法也很简单,就是在数据的第一行和第一列用数字来指定顺序。如下:

    OTUOTU1   2   3

    OTUOTUABC

    12Acetobacteraceae506.365321669611596.887241236994457.528142134733

    10Bacteroidaceae17.520928076934245.5871811395347352.221339584988

    8Dysgonomonadaceae1.8429742490513625.650030048729633.0226880824598

    6Lachnospiraceae5.6918576021782613.902062863390517.3870923992018

    11Lactobacillaceae174.95220577586237.94611502508958.8340146862225

    7Pseudomonadaceae2.132636213538828.629560709294812.7991010016856

    5Ruminococcaceae3.124728441908295.0612197612031127.4388235522058

    9Sphingomonadaceae257.8607015612787.113946230875618.98610815104722

    4Arcobacteraceae0.32949048460446717.9133872520980.426249200782749

    第一行指定了样品的顺序,而第一列按丰度指定物种的顺序。生成图片时要勾选下图红框中的选项(排序所用),不然会报错哦!

    新图如下:

    图中由于部分物种丰度较低,导致物种名重叠,解决这个问题可以改变文字的布局。这时就需要进行设置了。

    3.图片设置

    点击"settings"进入设置界面,会有很多的设置选项,可以对图片进行细调。

    这里只需要修改两个地方即可,将下图第一个红框改为“no”,可以调整文字为垂直布局,避免重叠;但是如果物种名太长,又可能会超出图片范围,所以要缩小圆圈的半径,即将第二个红框改为small。

    修改并保存设置后,重新生成图片:

    好了,今天我就先给大家介绍到这里,希望对您的科研能有所帮助!祝您工作生活顺心快乐!

    更多生物信息课程:

    1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接: 基因家族分析实操课程 、 基因家族文献思路解读

    2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接: 转录组(有参)结果解读 ; 转录组(无参)结果解读

    3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接: WGCNA-加权基因共表达网络分析

    4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接: 转录组标准分析后的数据挖掘 、 转录组文献解读

    5.  微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 、 OTU网络图绘制 、 cytoscape与网络图绘制课程

    6. 生物信息入门到精通必修基础课,学习链接: linux系统使用 、 perl入门到精通 、 perl语言高级 、 R语言画图

    7. 医学相关数据挖掘课程,不用做实验也能发文章,学习链接: TCGA-差异基因分析 、 GEO芯片数据挖掘 、 GSEA富集分析课程 、 TCGA临床数据生存分析 、 TCGA-转录因子分析 、 TCGA-ceRNA调控网络分析

    8.其他课程链接: 二代测序转录组数据自主分析 、 NCBI数据上传 、 二代测序数据解读 。

  • 数据流程图怎么画?

  • 数据流程图的制作方法十分简单,依次执行以下步骤,即可轻松绘制出一幅完整的数据流程图。

    第一步:下载“亿图图示”软件,或访问在线版亿图图示。打开软件界面,准备开始作图!

    第二步:新建数据流程图。先后点击“图表”-“数据流程图”。然后从素材库中,选择一个模板,点击打开数据流程图模板。

    第三步:先点击数据流程图,再点击右侧属性面板中的数据符号,最后点击“图表数据”,通过修改表格中的文字,即可改变画布中数据流程图文字。

    第四步:双击文本框,替换数据流程图模板里的文字。

    第五步:完成数据流程图的绘制后,可以点击右上角的保存、下载、打印、分享等按钮,对绘制好的数据流程图作品进行存储。也可以将作品导出为图片、PDF、PPT等格式。

  • 如何制作信息图(二):用Excel制作数据信息图表

  • excel里面画一些简单的柱状图、饼图....直接用插入里的在线图表可以画出来。但是如果你想要画的是专业一点的信息化图表,建议还是借助其他工具。

    比如说这种图表,里面涵盖了很多中类型的图表,但是经过简单的排列组合,就显得很大气,也更专业。

    这个图是亿图软件里的一个例子,你可以直接在软件上把文件导出到word、ppt、pdf、excel....里面,也很方便。

    最新文章 更多
    最新素材 更多
    公司介绍 网站地图 图片资讯
    Copyright © 2010-2022 山东找图网络科技有限公司  鲁ICP备18007836号-3  邮箱:15653358549@163.com