在线统计作图软件-origin软件是干什么的

Excel作图当然很low了,试试专门的作图软件吧。

SigmaPlot是一款高质量绘图软件,可以进行精密绘图、数据分析、自动化管理数据和创建网络图表。如果用户常常发表科技性文章及论文,并且有众多的数据需要用图形来展示,SigmaPlot将会是最佳选择。

软件可以精确呈现你的调查结果,是数据分析的得力工具,提供多种科学选项,例如:自动误差棒,回归线,置信区间。它包括一个强有力的非线性曲线拟合,一张极大的科学数据工作表用来容纳大规模的数据集,Sigmaplot 13软件获取地址:

大多数科研文章都离不开图表,尤其是图,熟悉一些绘图软件,并将图在文章和PPT中展示出来,是科研训练的重要内容。漂亮的文章配图能给自己的工作加不少分,生信宝典推出R的系列教程 ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色) 讲解通过R语言绘制高颜值图。后来为了更加方便使用,生信宝典团队开发了在线绘图工具 ,支持14中常见图形和部分扩增子分析,深受欢迎,日均访问400次,累计访问数十万次,遍及世界各大洲,功能也在一直增加完善中。

后台不少朋友说有更多绘图的需求,故整理了

Graphpad

的使用,一是传播知识,二是向优秀软件学习,让 在线绘图 越来越好。

Graphpad , Origin和SigmaPlot

是科研领常用的三款统计作图软件,他们各有优缺点,经常需要配合使用。

今天给大家介绍的是Graphpad的基本使用方法

下面是Graphpad的欢迎界面

从

方框1

处可知Graphpad Prism 6为用户提供了

6种

基本统计图表选择;

方框2

处是对所选类型图表的解释说明,点击 Learn more 查看官方帮助文档;

方框3

处可以选择某一类型图表下的小分类;

方框4

处则提供了演示数据集,方便新手入门。

6种统计图表类型的说明和使用的统计方法介绍如下:

在此选择 grouped 下提供的第二个现成数据集进行作图演示。选好后直接点击 creat 即可。

上一步之后我们便进入了graphpad操作的主界面,

方框1

处展示的是我们的数据,每个大组表示三种不同的细胞系(wild-type cells、GPP5 cell line和GPP7 cell line);每行表示不同的处理(血清饥饿和正常培养);每组5个平行重复。

该实验数据存在缺失值,如第一行的A:Y4。

方框2

处是一个

目录树

导入数据后,点击 Graphs 即可出图,如下:

在这个界面中,可以根据自己的需求改变图的类型。初学者要敢于

乱点

,自己试试不同的选项,就能知道每部分是什么功能了。( 尝试出真知 )

上面初步作出的统计图并没有展示诸如组间差异的统计分析结果,那我们要怎么添加 * 以展示组间差异呢?

在欢迎界面有 enter and plot error values already calculated elsewhere 选项,说明可以从外部导入在别处做好的统计分析结果,那是要去其他地方做好计算再来作图吗?

不需要!因为Graphpad上便可直接做统计分析!!!虽然可以在别的地方先做好分析,但是并不建议这样做,直接一个操作更便捷。

首先确定我们的分析目标:

1)评估细胞系之间的差异是否超过预期;

2)评估处理之间的差异是否超过预期的偶然性;

3)评估处理之间的差异是否与每种细胞系一致;

4)计算不同处理的细胞系之间差异的95%置信区间。

因此我们需要进行

两因素的方差分析

,点击 Analyze ,从Grouped分析列表中选择 Two-way ANOVA ,并接受对话框中的所有默认选项。Graphpad人性化之处在于,会自动识别当前分析的数据结构,给用户展示出最优的默认分析选项。

之后的具体分析便需要一定的统计学知识了,初生牛犊别怕试,你会发现点击不同的选项时,图示也会跟着变化,十分方便用户理解。

1)第一部分:实验设计,最开始提到了该组数据是非配对的,选第一;

2)第二部分:多重比较选择,就是你想要横着比还是竖着比或是斜着比;

3)第三部分:选择做统计分析的一些参数。

上面都设置好后,点击 OK ,分析结果会展示到操作主界面,并且保存到左侧 目录树 下的 Results 文件夹中。

1. 图形编辑工具栏介绍

1)第一部分:文档操作模块,跟office类似,如打开、新建、保存、复制粘贴等;

2)第二部分:数据分析,即之前演示的对录入数据进行统计分析;

3)第三部分:图形编辑,这部分是该软件的精华所在。可对图形进行例如图形类型、坐标轴、误差棒、图形大小、颜色等编辑更改;

4)第四部分:文字编辑,可以在统计图上插图线条、添加文字等;

5)第五部分:图形输出,可将做好的图导出、打印或输出到word/PPT中。

2. 根据之前的统计分析结果,利用文字编辑工具给统计图添上组间差异的标志

1)draw:可以插入不同形状的线;

2)write:编辑文字,插入公式等;

3)双击图形中的任一元素,可对文字、线条等进行形状、大小、粗细等编辑

3. 坐标轴调整

点击 Change 中的

第二个图标

,或者在图中

双击坐标轴

,调出坐标调整工具;

坐标轴整体设置和X轴设置,见图解,一般不做太多改动;

重点讲解如何设置Y轴,做出

截断图

,这是统计作图中常见的问题。

之前的数据相差不大,不太适合做演示,故另外生成了一个柱状图。左边柱子值太大,右边柱子值太小,右侧的柱子几乎消失了,使图看起来很不协调。做一个

截断图

可以很好地解决该问题。

1)点击坐标设置中的 Left Y axis (一般作图默认只生成左边的Y轴);

2) Gaps and Direction 处选择 Two segments ,即将Y轴断裂成两部分(根据实际数据,还可以选择将Y轴断裂成3段);

3)在 Segment 处,对下段(Bottom)和上段(Top)的Y轴分别设置参数(Rang);

4)然后在 Regularly spaced ticks 下的 Major ticks interval 处设置Y轴数值标签;

length:50%,上下段的长度各一半;

minimum:下段最小值0,上段最小值150;

maximum:下段最大值10,上段最大值200;

Major ticks:下段每格大小为2,上段每格大小为10。

这样便将Y轴10-150中间部分截掉了,整个图便显得好看多了。

4. 颜色修改

点击 Change 中的

最后一个图标

,或者在图中

双击柱子

,调出调整参数的工具框;

利用graphpad做统计图的基本操作大概就是以上这些内容,掌握一个工具的使用方法并不难,多试试便会了。难的是背后的统计学知识,如何对自己的数据选择合适的统计分析方法?当掌握不同分析方法适用于哪些数据结构后,便可以举一反三,对不同实验设计的数据做合适的分析了。

Origin是一款数据分析和绘图的软件,具备统计、峰值分析和曲线拟合等分析功能,可以绘制出二维和三维图形。

当前流行的图形可视化和数据分析软件有Matlab,Mathmatica和Maple等。这些软件功能强大,可满足科技工作中的许多需要,但使用这些软件需要一定的计算机编程知识和矩阵知识,并熟悉其中大量的函数和命令。而使用Origin就像使用Excel和Word那样简单,只需单击鼠标,选择菜单命令就可以完成大部分工作,获得满意的结果。

Origin具有两大主要功能:数据分析和绘图。Origin的数据分析主要包括统计、信号处理、图像处理、峰值分析和曲线拟合等各种完善的数学分析功能。准备好数据,进行数据分析时,只需选择所要分析的数据,然后再选择相应的菜单命令即可。

Origin的绘图是基于模板的,其本身提供了几十种二维和三维绘图模板并且允许用户自己定制模板。绘图时,只要选择所需要的模板就行。用户可以自定义数学函数、图形样式和绘图模板;可以和各种数据库软件、办公软件、图像处理软件等方便地连接。

Origin可以导入包括ASCII、Excel、pClamp在内的多种数据。另外,它可以把Origin图形输出到多种格式的图像文件,譬如JPEG、GIF、EPS、TIFF等。

Origin里面也支持编程,以方便拓展Origin的功能和执行批处理任务。Origin里面有两种编程语言―LabTalk和OriginC。在Origin的原有基础上,用户可以通过编写X-Function来建立自己需要的特殊工具。

X-Function不仅可以调用OriginC和NAG函数,而且可以很容易地生成交互界面。用户可以定制自己的菜单和命令按钮,把X-Function放到菜单和工具栏上,之后就可以非常方便地使用自己的定制工具。(注:X-Function是从8.0版本开始支持的。之前版本的Origin主要通过Add-OnModules来扩展Origin的功能。)

Origin软件发展历程

Origin最初是一个专门为微型热量计设计的软件工具,是由MicroCal公司开发的,主要用来将仪器采集到的数据作图,进行线性拟合以及各种参数计算。1992年,MicroCal软件公司正式公开发布Origin,公司后来改名为OriginLab。公司位于美国马萨诸塞州的汉普顿市。

Origin自1991年问世以来,版本从Origin4.0、5.0、6.0、7.0、8.0到2013年推出的9.0,软件不断推陈出新,逐步完善。在这20多年的时间里,Origin为世界上数以万计需要科技绘图、数据分析和图表展示软件的科技工作者提供了一个全面解决方案。