森林图在线绘制网站-【r<-图形】森林图forest plot绘制

首先调取Xena网页的TCGA数据做Cox生存分析,数据可以通过hiplot官网自主研发的ucsc-xena-shiny直接在线获取

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然后 全屏 显示,点击 Qucik PanCan Analysis 下方的 TCGA:Molcular Profile Cox Analysis

输入一个你想要的基因,比如 RAC3 , Select Measure for plot 可以设置 OS , PFI , DSS 和 DFI ,然后点上方的搜索????,就可以看到出的图了

更多定制,等你发现。。。

在线作图的网站有BoardMix协同白板。BoardMix协同白板是免费的在线思维导图、流程图、看板图绘制工具,集绘图、便签、互动文档、多媒体呈现、创意表达能力于一体,可用于日常灵感收集、思路整理、无边界创作,是提升团队在线协作的小帮手。

在运用BoardMix进行创作时,用户可以使用快捷键以提高工作效率,更高效地进行设计创作。BoardMix协同白板适用于个人创意表达、团队协作、线上教学、在线会议、头脑风暴、信息协同等众多场景。在BoardMix的创作都可以收纳进BLOCKS,BLOCKS折叠为CARD,多个CARD组成看板,是一款简洁高效的创作工具。BoardMix协同白板作为数字化多人在线实时协作平台,集思维导图、流程图、多种创意表达绘图工具于一体,打通协作成员之间的可视化捕捉灵感、创意表达、实时演示、高效协作整条链路,聚焦多人协作下的场景解决方案,加快团队之间的信息流转,降低协作成本,提高业务效率。

想要了解更多关于作图的相关信息,推荐选择BoardMix协同白板。BoardMix协同白板是一款基于浏览器的设计软件,用户无需下载客户端,登录网页即可使用。BoardMix协同白板不仅限于某个单独的操作系统使用,可以在macOS、Windows和Linux上运行,任何人都可以使用电子邮件或手机号码来注册BoardMix帐户。

森林图常见于元分析,但其使用绝不仅如此,比如我现在想要研究的对象有诸多HR结果,我想要汇总为一张图,森林图就是个非常好的选择。 ggpubr 包提供的森林图是针对变量分析绘图,我也尝试使用了 metafor 包的 forest 画图函数,但太灵活了,我除了感觉文档画的不错,但实际使用却很难得到想要的结果。

谷歌了一下,找到了 forestplot 这个包,下面根据 文档 学习一波。

安装:

森林图可以与文本连接起来并自定义。

下面是一个使用文本表的例子:

在上面基础进行增改:

我们可以修改线条类型和它所影响的范围:

为端点增加垂线:

还可以更改风格:

简单的,给超出范围的区间加箭头(clip):

这在对比时非常有用:

可以用方块、圆圈等:

添加一个基本图例:

通过设定参数可以进一步自定义:

我们可以手动设定想要的刻度

我们可以给想要的刻度加标签:

如果图形太高我们可能还需要增加辅助线以显示对应的刻度:

最后我们可以自定义想要的网格:

下面两种 structure 的书写方式是一致的:

文章作者 王诗翔

上次更新 2018-09-10

许可协议 CC BY-NC-ND 4.0